Zodra de kernel is geladen door de loader (zoals gewoonlijk) of door boot2 (zonder de loader), wordt er als ze er zijn gekeken naar de opstartvlaggen en wordt het gedrag zo nodig aangepast.
De meest voorkomende opstartvlaggen:
-aVraag tijdens de opstart van de kernel om het apparaat dat gemount moet worden als root bestandssysteem.
-CBoot van cd-rom.
-cStart UserConfig om instellingen te maken voor de kernel tijdens het opstarten.
-sStart naar single-user modus.
-vGeef meer tekst en uitleg tijdens het opstarten van de kernel.
Opmerking: In boot(8) staan alle bootvlaggen beschreven.